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  • 为什么说FPKM/RPKM是错的

    去年,我接触了一个RNA-seq的项目,做完之后,我重新思考了FPKM和RPKM的计算,觉得它们很可能是不对的,后来查阅了一些文献终于验证了我的想法。现在我重新将这个过程记录下来: 1. FPKM和RPKM分别是什么 RPKM是Reads Per Kilobase per Million的缩写,它的计算方程非常简单: $$RPKM = \frac{10 ^ 6 \times n_r}{L × ...

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    作者:解螺旋的矿工 | 分类:生物信息学 | 阅读:1,674 | 标签:,